一、进水压力：进水压力本身并不会影响盐透过量，但是进水压力升高使驱动反渗透的净压力升高，产水量加大，同时盐透过量几乎不变，增加的产水量稀释了透过膜的盐分，降低了透盐率，提高脱盐率。当进水压力超过一定值时，由于过高的回收率，加大浓差极化，又会导致盐透过量增加，抵消增加的产水量，使得脱盐率不再增加。
二、进水温度：温度对反渗透的运行压力、脱盐率、压降影响最为明显。温度上升，渗透性能增加，在一定水通量下要求的净推动力减少，因此实际运行压力降低。同时溶质透过速率也随温度的升高而增加，盐透过量增加，直接表现为产品水电导率升高。温度对反渗透各段的压降也有一定的影响，温度升高，水的粘度降低，压降减少。
反渗透膜产水电导对进水水温的变化十分敏感，随着水温的增加，水通量也线性增加，进水水温每升高1℃，透过膜的水分子粘度下降、扩散性能增强，产水通量就增加2.5%～3.0%。进水水温的升高，盐分透过膜的扩散速度会因温度的提高而加快，同样会导致透盐率的增加和脱盐率的下降。
三、进水pH值：各种膜组件都有一个允许的pH值范围，进水pH值对产水量几乎没有影响；但即使在允许范围内，pH值对脱盐率也有较大影响。一方面pH值对产品水的电导率也有一定的影响，由于反渗透膜本身大都带有一些活性基团，pH值可以影响膜表面的电场进而影响到离子的迁移，pH值对进水中杂质的形态有直接影响，如对可离解的有机物，其截留率随pH值的降低而下降；另一方面由于水中溶解的CO2受pH值影响较大，pH值低时以气态CO2形式存在，容易透过反渗透膜，所以pH低时脱盐率也较低，随pH升高，气态CO2转化为HCO3-和CO32-离子，脱盐率也逐渐上升，pH在7.5～8.5之间时，脱盐率达到最高。
四、进水盐浓度：渗透压是水中所含盐分或有机物浓度的函数，含盐量越高渗透压也增加，进水压力不变的情况下，净压力将减小，产水量降低。透盐率正比于反渗透膜正反两侧盐浓度差，进水含盐量越高，浓度差也越大，透盐率上升，从而导致脱盐率下降。对同一系统来说，给水含盐量不同，其运行压力和产品水电导率也有差别，给水含盐量每增加l00ppm，进水压力需增加约0.007MPa，同时由于浓度的增加，产品水电导率也相应的增加。
